水生植物的一个特点是通风组织非常繁荣,莲藕是典型的。例如，它的叶柄和莲藕中有许多孔，即通风道。孔与孔相连，相互贯穿，形成一个输送气体的通道网。这样，即使生长在没有氧气或氧气短缺的污泥中，它仍然可以生存。通风组织还可以增加浮力，保持身体平衡，这对水生植物也非常有益。水是生命的摇篮,水生环境中有许多藻类和水生植物。它们是牲畜饲料、鱼类食品或鱼类繁殖场所。

水生植物的细胞空间特别繁荣，通常有特殊的通风组织，以确保植物的水下部分有满意的氧气。水生植物的通风组织分为开放式和封闭式两类。莲莲等植物的通风组织是开放的，空气可以通过茎和叶的通风组织进入叶片的气孔，然后进入地下茎和根的气室。整个通风组织通过气孔直接与外部空气交流。金鱼藻等植物的通风组织是封闭的，不与外部大气相连，只储存光合作用和呼吸作用的二氧化碳光合作用的氧气。

水生植物的叶片面积一般增大表皮发育微小或在有的情况下几乎没有表皮。沉没在水中的叶片表皮上没有气孔，而漂浮在水面上的叶片表面气孔经常增加。此外，沉没在水中的叶片同化组织没有栅门组织和海绵组织的分化。水生植物叶片的这些特征是习水物种分散弱光和缺氧的环境条件的结果。水生植物在水中的叶片通常分为带状或丝状，以增加光、二氧化碳和无机盐的吸收面积。这些非常薄和剧烈分裂的叶片可以充分吸收水中丰富的无机盐和二氧化碳。爵床科的水罗兰就是一个典型的例子。它的叶子分为两种叶子，水上的叶子可以实现正常的光合作用，而沉没在水中的叶子也可以承担吸收无机盐的任务。

水生植物由于长期习惯于水环境，生活在静水或活动缓慢的水中的植物茎中的机械组织几乎消失了。根系发育很小，在某些情况下几乎没有根，主要是因为水中的叶子取代了根的吸收，如狐尾藻。 ​